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PRIMO 各种应用的汇总FAQ1

224 人阅读发布时间:2020-11-10 15:01

PRIMO 各种应用的FAQ汇总
森西万通科技(北京)有限公司

注:以下内容来自:
https://www.alveolelab.com/resources-support-center/faq/
 
  • 用PRIMO进行光照图案化(Photopatterning)的FAQ

注:以下FAQ内容来源于:
https://www.alveolelab.com/faq_topic/photopatterning-with-primo/

问1:与其他微图案化(Micropatterning)技术相比,PRIMO的光照图案化(Photopatterning)技术的优势有哪些?
答:PRIMO的解决方案给研究者提供实验操作的完全的自由度和全面的控制,使其可以很容易的优化实验条件。PRIMO可以快速建立任意形状的蛋白图案,以便精确的匹配或重叠不同的蛋白(可以无限制的使用多达3种蛋白,取决于使用的蛋白的种类和它们的相互作用),并控制吸附在基质上的局部的蛋白的密度。

问2:PRIMO可用于哪些应用?
答:(1)基质上的2D光图案化(2D photopatterning on substrate);
(2)3D微结构上的光图案化(Photopatterning on 3D microstructures);
(3)微制造(Microfabrication),如微流道芯片(microfluidic chip)制造。

问3:用PRIMO解决方案创建一个蛋白图案要多少时间?
答:创建一个图案(不包括图案设计步骤)的总体时间大概在10-15min。光照的时间各不相同,并且必须根据投射的图案和使用的物镜进行优化。在每次用UV照射并降解抗污聚合物涂层(anti-fouling polymer)(抗粘附)的步骤之后,都需要大概5min以便蛋白能吸附在图案上(时间随着放置在基质上的蛋白浓度的不同而变化)。

问4:细胞图案能稳定多久?
答:细胞图案的稳定的时间长度取决于使用的基质和培养的细胞类型。在一定的条件下,细胞能粘附在蛋白图案上长达2周。我们的研发团队会定期开发一些新的实验步骤供我们的用户选择。

问5:用PRIMO能否在水凝胶上打印出蛋白图案?
答:我们建议采取转移的技术(transfer technique),用PRIMO在载玻片上打印蛋白图案,再将载玻片放置在水凝胶上然后移除。如果用UV照射将蛋白光图案化到水凝胶上,往往会改变水凝胶的物理特性,然后改变一开始设定的实验条件。

问6:载玻片能提前包被吗?
答:我们推荐在同一天进行蛋白包被。然而,我们的研发团队也针对特定的基质定期开发新的实验方案,使保存用蛋白包被好的载玻片以供后用成为可能。

问7:为什么表面处理对于光照图案法很重要?
答:光照图案法是一个“减法”技术。它的首要目标是使用抗污聚合物包被基质,这样可以防止分子和细胞的粘附。然后在UV光和光活化试剂(PLPP)的共同作用下,使用PRIMO系统来局部降解这个抗粘附表层。

问8:PRIMO能允许在无菌的条件下进行实验吗?
答:可以。用PRIMO操作的实验可以在无菌的环境下进行,即使PRIMO仪器没有设置在无菌的房间中。这时,我们推荐在生物安全柜(BSC)中进行所有的洗涤和培养步骤,然后将样本放入一个封闭的培养板,然后放到PRIMO仪器的电动载物台上。

问9:PRIMO能用来在3D结构上打印蛋白图案吗?
答:PRIMO可用来在各种表面上打印图案,无论是否是平的、卷曲的或是有微结构的。例如,它可以将蛋白打印在微孔板的孔壁上,或PDMS的微柱上。可以按需提供这些内部数据。

问10:是否总是将光活化PLPP试剂和PRIMO配套使用?
答:PLPP可以加速光图像化过程中,抗污聚合物的降解作用(只需几秒钟,而不是几小时)。然而,使用SU8树脂或NOA进行微制造(microfabrication)操作是不需要使用PLPP的,因为这些材料在PRIMO光波长(375nm)下是光敏感的。

问11:在基质上需要进行什么样的抗污聚合物表面处理?
答:我们推荐使用PLL-PEG聚合物。我们定期开发新的实验方法以促进表面包被层的稳定性。

问12:仪器的视野的深度有多少?
答:当使用20x物镜时,激光穿透透明基质的视野的深度大概是200-300µm。

问13:仪器的分辨率有多少?
答:当使用20x物镜时,在大概500x300µm的视野中,整个视野的分辨率是1.2µm。

问14:能做的最大图案尺寸是多少?
答:PRIMO可以做任意尺寸的图案,没有大小限制。

问15:用PRIMO仪器哪些蛋白可以被图案化?
答:我们的团队和用户使用超过10种不同的蛋白,包括:Fibrinogen-488、Fibrinogen‐647、Fibronectin、GFP、Neutravidin‐488、Neutravidin‐647、PLL‐PEG‐Biotin、Protein A‐647、Streptavidin,和初级、次级抗体。

问16:用PRIMO仪器,哪些基质可以用来进行蛋白的光图像化操作?
答:PRIMO可用来对各种标准细胞培养基质进行图案化,包括:PDMS、玻璃、塑料、NOA、SU8。我们的研发团队也在定期测试和验证新的基质。可以按需提供这些内部数据。

问17:用PRIMO进行微制造(Microfabrication)时,需要用到哪些光阻材料(Photoresist)?
答:所有在375nm下敏感的光阻材料都可以与PRIMO配套使用。我们的研发团队主要用SU8光阻材料。
 
  • PRIMO表面蛋白涂层法/微图案法(micropatterning)进行Cryo-ET成像FAQ

注:以下FAQ内容来源于:
https://www.alveolelab.com/faq_topic/primo-micropatterning-cryoet/
可参考:https://www.alveolelab.com/applications/cryo-em-grid-micropatterning/

问1:使用PRIMO准备Cryo-ET(冷冻电镜)细胞样本有什么不同?
答:PRIMO无掩膜微图案系统(maskless micropatterning system)可以用来控制细胞的粘附。因此,它能保证多个细胞精确地定位在电镜网格中(一般在网格的网眼正方形的中央)。而且,它能使您完全控制创建的微图案的设计。正如我们用户的研究论文所述,您可以控制细胞的形状、极性、伸展性,以便进行:
  1. 生物力学研究;
  2. 帮助进行FIB milling操作;
  3. 保证重复性和更有效的cryo-ET成像。

问2:PRIMO微图案法技术和所有电镜网格(EM grids)都兼容吗?
答:目前为止,我们检测了不同的网格材料,我们可以确定PRIMO微图案系统可以用于由碳膜、SiO2膜、硅氮化物膜(Silicon Nitride film)组成的网格,可以包含或不包含网眼。作为一种无掩膜微图案法技术,它可以与所有经典的电镜网格兼容。如果您想查证它是否和您的网格模型兼容,可以联系我们。

问3:能否检测我使用的透射电镜网格(TEM grids)是否可使用PRIMO?
答:我们可以提供多种选择来检测PRIMO微图案系统。您可以联系我们来讨论您的cryo-ET实验,以便发现检测PRIMO的最好的解决办法。

问4:PRIMO系统可以透过膜进行微图案化(micropatterning)吗?
答:使用UV光穿透网格的膜进行微图案设计是可行的,因为膜是透明的。如果您想在网眼中进行图案设计,要确保放在电动载物台(the motorized stage of the setup)上的网格是上下颠倒的(需要设计的膜的一面朝向物镜一侧)

问5:我怎么确定我设计的微图案处在电镜网格的网眼范围内?
答:Leonardo photopatterning software可以自动检测电镜网格的网眼。然后可以将微图案定位于其中,并调整图案尺寸使其完美契合。当然,Leonardo software也能进行预期结果的预览,因此您能在进行微图案化操作之前进行任何手动的修改。

问6:准备微图案化的电镜网格的过程需要多久?
答:每天您可生成5-15个微图案化的电镜网格,包括了从anti-fouling coating到protein incubation的所有步骤。

问7:操作电镜网格是一个精细的步骤,看上去这个过程增加了更多的操作步骤,有没有解决办法呢?
答:的确,微图案化的过程增加了更多的操作步骤,但是经过培训,您将学会如何进行微图案化操作而不会损坏电镜网格。进一步而言,我们能开发特定的PDMS stencils(PDMS模板),可以将网格放置在盖玻片(或其他物品)上,并在整个操作流程中保持其位置不动,以减少对网格的操作。

问8:用PRIMO系统在电镜网格上得到的微图案的分辨率是多少?
答:用PRIMO无掩膜微图案系统在电镜网格中得到的微图案的分辨率是1.2µm,与在玻璃上得到的分辨率一致。

问9:能否在种植细胞之前保存已经进行微图案化的网格,能保存多久?
答:可以,在吸附蛋白之前,准备好的电镜网格可以在PBS溶液中保存一个月。

问10:PEG覆盖层的厚度是多少?
答:PEG覆盖层的厚度大概是5nm。

问11:在电镜网格微图案化之后,什么样的细胞可以种植上去?
答:与在玻璃上进行微图案化操作一样,经典的哺乳动物贴壁细胞可以种植在TEM网格的微图案上。目前为止,我们团队和用户已经成功操作的细胞包括:HeLa细胞、成纤维细胞(fibroblasts)、内皮细胞(epithelial cells)、MDCKⅡ、PtK1。

问12:微图案化对细胞的状态和功能的影响如何?
答:通过控制细胞粘附,微图案化对它们的功能和行为有一定的影响。因为能建立更受控的、重现性更强的体外生化微环境,微图案法能在更加生理相关的条件下研究活细胞(Thery, Journal of Cell Science,2010)

问13:有没有利用你们的技术进行Cryo-ET研究的论文可供参考?
答:有的,您可以参考以下论文:
【1】M. Toro-Nahuelpan et.al., Tailoring cryo-electron microscopy grids by photo-micropatterning for in-cell structural studies, Nature Methods, 17, pp.50–54 (2020), https://doi.org/10.1038/s41592-019-0630-5 (Julia Mahamid's lab, EMBL)
【2】L. Engel et.al., Extracellular matrix micropatterning technology for whole cell cryogenic electron microscopy studies, Journal of Micromechanics and Microengineering, Volume 29, Number 11 (2019), https://doi.org/10.1088/1361-6439/ab419a (Beth Pruitt's lab, Stanford University, UC Santa Barbara)
【3】L. Engel et.al., Lattice micropatterning of electron microscopy grids for improved cellular cryo-electron tomography throughput, BioRxiv, posted Aug 31,2020, doi: https://doi.org/10.1101/2020.08.30.272237 (Alexander Dunn's lab, Stanford University)
 
 

 
资料格式:

PRIMO 各种应用的FAQ汇总水印 - 20201110.pdf

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